El jugador fue fundamental en la obtención del tercer lugar. Además, disputó el Mundial Sub 20 de Qatar 1995.
Bajo la dirección de Leonardo Véliz, el volante se ganó un lugar en el proceso de La Roja Sub 17 hacia el Sudamericano de la categoría en 1993. En el torneo, Chile fue subcampeón y consiguió uno de los tres cupos al Mundial de Japón.
En la competición juvenil, participó en seis partidos, incluida la definición por el tercer lugar ante Polonia, donde pateó uno de los penales que zanjó el duelo a favor de Chile.
En 1995, tras haber debutado en Primera División por Colo Colo, Lobos integró los planteles que disputaron el Sudamericano Sub 20 en Bolivia y el Mundial de la categoría en Qatar.
En 2006, el volante se retiró del profesionalismo vistiendo la camiseta de Vasco de Gama.
