El portero también acompañó a la Selección juvenil en el Sudamericano de Paraguay ese año, donde consiguieron el tercer lugar.
Patricio Vargas fue citado por Vladimir Bigorra para la Selección Sub 17 en 1997, y disputó el Sudamericano de la categoría en Paraguay, donde La Roja conquistó el tercer lugar y clasificó a la Copa del Mundo.
Meses más tarde, el en ese entonces jugador de O’Higgins acompañó a la escuadra nacional al Mundial de Egipto, en el cual Chile consiguió un triunfo –por goleada–, un empate y una derrota.
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