El defensa participó en tres compromisos de aquella campaña, que culminó con La Roja alcanzando los octavos de final.
Formado en las divisiones inferiores de Colo Colo, Sebastián Montecinos registró sus primeras apariciones oficiales con la Sub 20 en el marco del Sudamericano de la categoría en 2005, disputado en Colombia.
Dirigido por José Sulantay y con compañeros como Matías Fernández, Carlos Carmona, Gonzalo Jara y José Pedro Fuenzalida, entre otros, el defensa fue pieza importante en la clasificación de Chile al Mundial Sub 20 de Holanda.
Ya en la Copa del Mundo, Montecinos sumó minutos en los partidos ante Honduras y España por la fase de grupos, y frente al local por los octavos de final.
Tras más de una década de carrera profesional, el zaguero se retiró del fútbol en 2016, tras pasar por distintos elenco nacionales.