El jugador cuenta con pasos por todas las selecciones juveniles. Además, en 2019 disputó el Sudamericano y la Copa del Mundo de la categoría Sub 17, siendo uno de los futbolistas más destacados.
Formado en Universidad Católica, Gonzalo Tapia tuvo su primer contacto oficial con la Selección Chilena en 2017 para el Sudamericano Sub 15 en Argentina. En el torneo, disputó todos los partidos y registró cuatro anotaciones.
En 2019, el delantero participó del Sudamericano Sub 17 de Perú, donde fue uno de los puntos altos del subcampeonato que consiguió La Roja, con ocho presencias y tres goles. La campaña le otorgó al elenco juvenil la clasificación al Mundial de la categoría.
En la Copa del Mundo, La Roja Sub 17 contó con Tapia en los duelos ante Francia, Haití, Corea del Sur y en octavos de final ante el local Brasil. Frente a los centroamericanos, el atacante convirtió un gol y otorgó dos asistencias.
En 2020, se integró a la Selección Sub 20 y participó de un torneo amistoso en Brasil, donde sumó tres goles. Además, ha sido nominado a microciclos de la Sub 23 y la Adulta; este último ya bajo la dirección de Martín Lasarte en 2021.
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